Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2BP0DI82 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2BP0DI82 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2BP0DI82 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2BP0DI82 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2BP0DI82 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2BP0DI82 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2BP0DI82 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2BP0DI82 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2BP0DI82 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2BP0DI82 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2BP0DI82 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2BP0DI82 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2BP0DI82 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2BP0DI82 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2BP0DI82 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2BP0DI82 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2BP0DI82 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2BP0DI82 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2BP0DI82 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2BP0DI82 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2BP0DI82 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2BP0DI82 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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