Protein–RNA interactions for Protein: P0DI81

TRAPPC2, Trafficking protein particle complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2P0DI81 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2P0DI81 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2P0DI81 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2P0DI81 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2P0DI81 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2P0DI81 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2P0DI81 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2P0DI81 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2P0DI81 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2P0DI81 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2P0DI81 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2P0DI81 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2P0DI81 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2P0DI81 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2P0DI81 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2P0DI81 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2P0DI81 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2P0DI81 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2P0DI81 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2P0DI81 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2P0DI81 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2P0DI81 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2P0DI81 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms