Protein–RNA interactions for Protein: P07988

SFTPB, Pulmonary surfactant-associated protein B, humanhuman

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPBP07988 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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SFTPBP07988 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SFTPBP07988 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SFTPBP07988 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SFTPBP07988 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SFTPBP07988 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SFTPBP07988 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SFTPBP07988 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SFTPBP07988 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SFTPBP07988 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SFTPBP07988 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SFTPBP07988 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFTPBP07988 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFTPBP07988 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFTPBP07988 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFTPBP07988 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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