Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEFMP07197 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEFMP07197 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEFMP07197 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NEFMP07197 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NEFMP07197 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEFMP07197 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEFMP07197 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEFMP07197 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEFMP07197 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEFMP07197 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEFMP07197 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEFMP07197 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEFMP07197 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEFMP07197 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEFMP07197 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NEFMP07197 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NEFMP07197 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEFMP07197 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEFMP07197 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEFMP07197 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEFMP07197 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEFMP07197 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEFMP07197 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NEFMP07197 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NEFMP07197 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NEFMP07197 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NEFMP07197 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NEFMP07197 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NEFMP07197 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NEFMP07197 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NEFMP07197 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEFMP07197 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEFMP07197 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEFMP07197 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
NEFMP07197 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEFMP07197 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NEFMP07197 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NEFMP07197 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEFMP07197 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEFMP07197 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEFMP07197 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEFMP07197 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEFMP07197 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NEFMP07197 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEFMP07197 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEFMP07197 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEFMP07197 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEFMP07197 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEFMP07197 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEFMP07197 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEFMP07197 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEFMP07197 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NEFMP07197 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEFMP07197 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEFMP07197 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEFMP07197 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEFMP07197 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEFMP07197 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEFMP07197 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEFMP07197 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEFMP07197 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEFMP07197 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEFMP07197 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEFMP07197 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEFMP07197 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEFMP07197 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEFMP07197 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEFMP07197 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEFMP07197 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEFMP07197 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEFMP07197 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEFMP07197 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEFMP07197 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEFMP07197 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEFMP07197 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEFMP07197 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEFMP07197 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEFMP07197 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEFMP07197 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NEFMP07197 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEFMP07197 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEFMP07197 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEFMP07197 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEFMP07197 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEFMP07197 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEFMP07197 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEFMP07197 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEFMP07197 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEFMP07197 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEFMP07197 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEFMP07197 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEFMP07197 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEFMP07197 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEFMP07197 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEFMP07197 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEFMP07197 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEFMP07197 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEFMP07197 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NEFMP07197 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms