Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZBED1O96006 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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