Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLSTN1O94985 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms