Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
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