Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms