Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms