Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
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