Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
E9PCH4 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
E9PCH4 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
E9PCH4 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
E9PCH4 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
E9PCH4 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
E9PCH4 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
E9PCH4 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
E9PCH4 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
E9PCH4 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
E9PCH4 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
E9PCH4 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
E9PCH4 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
E9PCH4 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
E9PCH4 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
E9PCH4 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
E9PCH4 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
E9PCH4 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
E9PCH4 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
E9PCH4 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
E9PCH4 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
E9PCH4 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
E9PCH4 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
E9PCH4 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
E9PCH4 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
E9PCH4 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
E9PCH4 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
E9PCH4 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
E9PCH4 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
E9PCH4 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
E9PCH4 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
E9PCH4 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
E9PCH4 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
E9PCH4 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
E9PCH4 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
E9PCH4 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
E9PCH4 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
E9PCH4 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
E9PCH4 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
E9PCH4 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
E9PCH4 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
E9PCH4 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
E9PCH4 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
E9PCH4 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
E9PCH4 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
E9PCH4 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
E9PCH4 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
E9PCH4 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
E9PCH4 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
E9PCH4 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
E9PCH4 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
E9PCH4 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
E9PCH4 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
E9PCH4 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
E9PCH4 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
E9PCH4 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
E9PCH4 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
E9PCH4 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
E9PCH4 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
E9PCH4 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
E9PCH4 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
E9PCH4 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
E9PCH4 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
E9PCH4 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
E9PCH4 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
E9PCH4 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
E9PCH4 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
E9PCH4 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
E9PCH4 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
E9PCH4 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
E9PCH4 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
E9PCH4 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
E9PCH4 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
E9PCH4 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
E9PCH4 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
E9PCH4 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
E9PCH4 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
E9PCH4 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
E9PCH4 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
E9PCH4 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
E9PCH4 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
E9PCH4 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
E9PCH4 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
E9PCH4 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
E9PCH4 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
E9PCH4 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
E9PCH4 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
E9PCH4 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
E9PCH4 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
E9PCH4 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
E9PCH4 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
E9PCH4 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
E9PCH4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
E9PCH4 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
E9PCH4 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
E9PCH4 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
E9PCH4 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
E9PCH4 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
E9PCH4 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
E9PCH4 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms