Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms