Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms