Protein–RNA interactions for Protein: A6NJ08

MBD3L5, Putative methyl-CpG-binding domain protein 3-like 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3L5A6NJ08 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms