Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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