Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WUJ7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WUJ7 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A087WUJ7 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms