Protein–RNA interactions for Protein: W5XKT8

SPACA6, Sperm acrosome membrane-associated protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPACA6W5XKT8 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms