Protein–RNA interactions for Protein: U3KPZ7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,027 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KPZ7 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
U3KPZ7 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
U3KPZ7 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
U3KPZ7 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
U3KPZ7 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
U3KPZ7 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
U3KPZ7 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
U3KPZ7 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
U3KPZ7 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
U3KPZ7 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
U3KPZ7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
U3KPZ7 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
U3KPZ7 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
U3KPZ7 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
U3KPZ7 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
U3KPZ7 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
U3KPZ7 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
U3KPZ7 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
U3KPZ7 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
U3KPZ7 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
U3KPZ7 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
U3KPZ7 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
U3KPZ7 AC090152.1-202ENST00000518993 1079 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
U3KPZ7 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
U3KPZ7 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
U3KPZ7 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
U3KPZ7 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
U3KPZ7 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
U3KPZ7 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
U3KPZ7 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
U3KPZ7 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
U3KPZ7 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
U3KPZ7 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
U3KPZ7 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
U3KPZ7 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
U3KPZ7 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
U3KPZ7 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
U3KPZ7 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
U3KPZ7 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
U3KPZ7 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
U3KPZ7 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
U3KPZ7 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
U3KPZ7 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
U3KPZ7 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
U3KPZ7 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
U3KPZ7 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
U3KPZ7 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
U3KPZ7 LINC01221-201ENST00000432488 662 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
U3KPZ7 AC005324.2-201ENST00000433051 415 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
U3KPZ7 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
U3KPZ7 IL12A-205ENST00000480787 863 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
U3KPZ7 AC137794.1-201ENST00000509185 914 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
U3KPZ7 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
U3KPZ7 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
U3KPZ7 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
U3KPZ7 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
U3KPZ7 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
U3KPZ7 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
U3KPZ7 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
U3KPZ7 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
U3KPZ7 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
U3KPZ7 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
U3KPZ7 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
U3KPZ7 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
U3KPZ7 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
U3KPZ7 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
U3KPZ7 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
U3KPZ7 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
U3KPZ7 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
U3KPZ7 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
U3KPZ7 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
U3KPZ7 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
U3KPZ7 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
U3KPZ7 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
U3KPZ7 AC246787.1-201ENST00000392301 627 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
U3KPZ7 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
U3KPZ7 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
U3KPZ7 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
U3KPZ7 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
U3KPZ7 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
U3KPZ7 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
U3KPZ7 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
U3KPZ7 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
U3KPZ7 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
U3KPZ7 LINC00888-202ENST00000471496 1490 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
U3KPZ7 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
U3KPZ7 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
U3KPZ7 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
U3KPZ7 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
U3KPZ7 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
U3KPZ7 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
U3KPZ7 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
U3KPZ7 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
U3KPZ7 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
U3KPZ7 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
U3KPZ7 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
U3KPZ7 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
U3KPZ7 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
U3KPZ7 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
U3KPZ7 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms