Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAF6Q9Y4K3 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.5 ms