Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms