Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms