Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms