Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms