Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms