Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms