Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms