Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms