Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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