Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms