Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ6

EXTL2, Exostosin-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL2Q9UBQ6 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.02■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.02■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EXTL2Q9UBQ6 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms