Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms