Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms