Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWS1

PARPBP, PCNA-interacting partner, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARPBPQ9NWS1 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PARPBPQ9NWS1 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms