Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW64

RBM22, Pre-mRNA-splicing factor RBM22, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM22Q9NW64 PSMA3-AS1-208ENST00000555275 903 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.462e-7■■■□□ 15
RBM22Q9NW64 PSMA3-AS1-201ENST00000551597 507 ntTSL 1 (best)11.89□□□□□ -0.512e-7■■■□□ 15
RBM22Q9NW64 PSMA3-AS1-214ENST00000557660 2360 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.742e-7■■■□□ 15
RBM22Q9NW64 PSMA3-AS1-209ENST00000555707 1983 ntTSL 1 (best)10.35□□□□□ -0.752e-7■■■□□ 15
RBM22Q9NW64 PSMA3-AS1-205ENST00000554378 741 ntTSL 1 (best)9.82□□□□□ -0.842e-7■■■□□ 15
RBM22Q9NW64 PSMA3-AS1-204ENST00000554360 2475 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.852e-7■■■□□ 15
RBM22Q9NW64 PSMA3-AS1-210ENST00000556002 1039 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.092e-7■■■□□ 15
RBM22Q9NW64 C14orf37-203ENST00000554218 572 ntTSL 48.1□□□□□ -1.112e-7■■■□□ 15
RBM22Q9NW64 PSMA3-AS1-206ENST00000555037 446 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.292e-7■■■□□ 15
RBM22Q9NW64 PSMA3-AS1-203ENST00000554309 597 ntTSL 36.43□□□□□ -1.382e-7■■■□□ 15
RBM22Q9NW64 PSMA3-AS1-202ENST00000553657 398 ntTSL 35.34□□□□□ -1.552e-7■■■□□ 15
RBM22Q9NW64 SON-208ENST00000455528 8394 ntTSL 1 (best)12.32□□□□□ -0.448e-7■■■□□ 15
RBM22Q9NW64 SON-201ENST00000300278 7477 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.518e-7■■■□□ 15
RBM22Q9NW64 SON-202ENST00000356577 8813 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.618e-7■■■□□ 15
RBM22Q9NW64 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.588e-7■■■□□ 15
RBM22Q9NW64 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.632e-11■■■□□ 15
RBM22Q9NW64 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.212e-11■■■□□ 15
RBM22Q9NW64 DKC1-202ENST00000412124 670 ntTSL 57.26□□□□□ -1.252e-6■■■□□ 15
RBM22Q9NW64 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.222e-8■■■□□ 15
RBM22Q9NW64 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.142e-8■■■□□ 15
RBM22Q9NW64 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.12e-8■■■□□ 15
RBM22Q9NW64 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.142e-8■■■□□ 15
RBM22Q9NW64 RNF123-210ENST00000487805 5882 ntTSL 213.77□□□□□ -0.21e-8■■■□□ 15
RBM22Q9NW64 RNF123-209ENST00000486102 4564 ntTSL 1 (best)12.26□□□□□ -0.451e-8■■■□□ 15
RBM22Q9NW64 RNF123-207ENST00000457726 4506 ntTSL 1 (best)10.93□□□□□ -0.661e-8■■■□□ 15
RBM22Q9NW64 RNF123-201ENST00000327697 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.721e-8■■■□□ 15
RBM22Q9NW64 HGD-201ENST00000283871 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -16e-7■■■□□ 15
RBM22Q9NW64 RTKN-209ENST00000484453 820 ntTSL 1 (best)22.41■■□□□ 1.189e-22■■■□□ 15
RBM22Q9NW64 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.263e-19■■■□□ 14.9
RBM22Q9NW64 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.243e-19■■■□□ 14.9
RBM22Q9NW64 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.083e-19■■■□□ 14.9
RBM22Q9NW64 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.123e-19■■■□□ 14.9
RBM22Q9NW64 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.293e-19■■■□□ 14.9
RBM22Q9NW64 ZMYM3-209ENST00000489332 5723 ntTSL 511.85□□□□□ -0.513e-19■■■□□ 14.9
RBM22Q9NW64 ZMYM3-201ENST00000314425 5536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.723e-19■■■□□ 14.9
RBM22Q9NW64 ZMYM3-205ENST00000373984 5253 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.773e-19■■■□□ 14.9
RBM22Q9NW64 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.922e-6■■■□□ 14.9
RBM22Q9NW64 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.752e-6■■■□□ 14.9
RBM22Q9NW64 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.742e-6■■■□□ 14.9
RBM22Q9NW64 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.672e-6■■■□□ 14.9
RBM22Q9NW64 MYC-204ENST00000520751 577 ntTSL 319.14■□□□□ 0.652e-6■■■□□ 14.9
RBM22Q9NW64 CPNE7-208ENST00000566398 672 ntTSL 319.05■□□□□ 0.642e-6■■■□□ 14.9
RBM22Q9NW64 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.592e-6■■■□□ 14.9
RBM22Q9NW64 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.582e-6■■■□□ 14.9
RBM22Q9NW64 CPNE7-209ENST00000568977 682 ntTSL 518.57■□□□□ 0.562e-6■■■□□ 14.9
RBM22Q9NW64 CPNE7-204ENST00000526232 488 ntTSL 318.12■□□□□ 0.492e-6■■■□□ 14.9
RBM22Q9NW64 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.482e-6■■■□□ 14.9
RBM22Q9NW64 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.454e-21■■■□□ 14.9
RBM22Q9NW64 CPNE7-207ENST00000564421 517 ntTSL 317.37■□□□□ 0.372e-6■■■□□ 14.9
RBM22Q9NW64 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.345e-9■■■□□ 14.9
RBM22Q9NW64 CIAO1-204ENST00000491394 748 ntTSL 216.83■□□□□ 0.282e-6■■■□□ 14.9
RBM22Q9NW64 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.192e-6■■■□□ 14.9
RBM22Q9NW64 HINT1-206ENST00000508495 825 ntTSL 1 (best)16.05■□□□□ 0.165e-9■■■□□ 14.9
RBM22Q9NW64 HINT1-209ENST00000513345 656 ntTSL 215.68■□□□□ 0.15e-9■■■□□ 14.9
RBM22Q9NW64 POLR1C-207ENST00000481352 1725 ntTSL 515.63■□□□□ 0.092e-6■■■□□ 14.9
RBM22Q9NW64 DMTF1-214ENST00000434534 581 ntTSL 415.57■□□□□ 0.082e-6■■■□□ 14.9
RBM22Q9NW64 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.034e-21■■■□□ 14.9
RBM22Q9NW64 TRAPPC12-211ENST00000452495 544 ntTSL 414.78□□□□□ -0.042e-6■■■□□ 14.9
RBM22Q9NW64 BZW2-209ENST00000437745 1711 ntTSL 1 (best)14.55□□□□□ -0.082e-6■■■□□ 14.9
RBM22Q9NW64 MYC-203ENST00000517291 1023 ntTSL 1 (best)14.18□□□□□ -0.142e-6■■■□□ 14.9
RBM22Q9NW64 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.152e-6■■■□□ 14.9
RBM22Q9NW64 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.175e-9■■■□□ 14.9
RBM22Q9NW64 LRPPRC-205ENST00000447246 1209 ntTSL 1 (best)13.82□□□□□ -0.22e-6■■■□□ 14.9
RBM22Q9NW64 BZW2-210ENST00000438834 674 ntTSL 413.72□□□□□ -0.212e-6■■■□□ 14.9
RBM22Q9NW64 HINT1-204ENST00000506908 681 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.235e-9■■■□□ 14.9
RBM22Q9NW64 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.232e-6■■■□□ 14.9
RBM22Q9NW64 RBM33-206ENST00000392761 2934 ntTSL 213.52□□□□□ -0.252e-6■■■□□ 14.9
RBM22Q9NW64 MRPS27-204ENST00000508863 956 ntTSL 313.19□□□□□ -0.32e-6■■■□□ 14.9
RBM22Q9NW64 POLR1C-206ENST00000455605 1882 ntTSL 513.08□□□□□ -0.322e-6■■■□□ 14.9
RBM22Q9NW64 POLR1C-204ENST00000423780 418 ntTSL 513.02□□□□□ -0.332e-6■■■□□ 14.9
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RBM22Q9NW64 TRAPPC12-206ENST00000417243 1047 ntTSL 512.75□□□□□ -0.372e-6■■■□□ 14.9
RBM22Q9NW64 TRAPPC12-216ENST00000469400 720 ntTSL 212.59□□□□□ -0.393e-7■■■□□ 14.9
RBM22Q9NW64 TRAPPC12-207ENST00000433382 578 ntTSL 512.44□□□□□ -0.422e-6■■■□□ 14.9
RBM22Q9NW64 CIAO1-201ENST00000272402 3588 ntTSL 212.25□□□□□ -0.452e-6■■■□□ 14.9
RBM22Q9NW64 BZW2-204ENST00000415365 1405 ntTSL 1 (best)12.18□□□□□ -0.462e-6■■■□□ 14.9
RBM22Q9NW64 POLR1C-202ENST00000372344 1119 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.492e-6■■■□□ 14.9
RBM22Q9NW64 RBM33-207ENST00000401878 10149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.512e-6■■■□□ 14.9
RBM22Q9NW64 BZW2-214ENST00000630952 1721 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.532e-6■■■□□ 14.9
RBM22Q9NW64 BZW2-211ENST00000446596 859 ntTSL 311.39□□□□□ -0.592e-6■■■□□ 14.9
RBM22Q9NW64 HINT1-208ENST00000513012 583 ntTSL 4 BASIC11.18□□□□□ -0.625e-9■■■□□ 14.9
RBM22Q9NW64 TRAPPC12-204ENST00000415624 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 511.13□□□□□ -0.632e-6■■■□□ 14.9
RBM22Q9NW64 RBM33-202ENST00000307403 4360 ntTSL 210.95□□□□□ -0.662e-6■■■□□ 14.9
RBM22Q9NW64 MRPS27-205ENST00000513900 1369 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.662e-6■■■□□ 14.9
RBM22Q9NW64 RPL32-203ENST00000396957 1749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.682e-6■■■□□ 14.9
RBM22Q9NW64 RPL32-204ENST00000429711 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.772e-6■■■□□ 14.9
RBM22Q9NW64 HINT1-207ENST00000511475 923 ntTSL 310.15□□□□□ -0.785e-9■■■□□ 14.9
RBM22Q9NW64 BZW2-207ENST00000433922 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.822e-6■■■□□ 14.9
RBM22Q9NW64 MRPS27-211ENST00000522042 578 ntTSL 49.92□□□□□ -0.822e-6■■■□□ 14.9
RBM22Q9NW64 BZW2-202ENST00000405202 1689 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.832e-6■■■□□ 14.9
RBM22Q9NW64 BZW2-212ENST00000452975 1464 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.842e-6■■■□□ 14.9
RBM22Q9NW64 ALDH1A2-224ENST00000561070 554 ntTSL 49.73□□□□□ -0.852e-6■■■□□ 14.9
RBM22Q9NW64 BZW2-201ENST00000258761 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.882e-6■■■□□ 14.9
RBM22Q9NW64 TMOD1-203ENST00000395211 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.952e-6■■■□□ 14.9
RBM22Q9NW64 RPL32-201ENST00000273223 567 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.972e-6■■■□□ 14.9
RBM22Q9NW64 BZW2-206ENST00000432311 800 ntTSL 38.92□□□□□ -0.982e-6■■■□□ 14.9
RBM22Q9NW64 MRPS27-207ENST00000515404 1183 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.992e-6■■■□□ 14.9
RBM22Q9NW64 BZW2-208ENST00000436868 1784 ntTSL 58.8□□□□□ -12e-6■■■□□ 14.9
RBM22Q9NW64 MRPS27-214ENST00000522562 832 ntTSL 1 (best)8.15□□□□□ -1.12e-6■■■□□ 14.9
RBM22Q9NW64 BZW2-213ENST00000480517 2101 ntTSL 27.49□□□□□ -1.212e-6■■■□□ 14.9
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