Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED17Q9NVC6 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms