Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms