Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms