Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms