Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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