Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms