Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms