Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms