Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms