Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms