Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms