Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQN1

FAM83C, Protein FAM83C, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM83CQ9BQN1 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM83CQ9BQN1 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM83CQ9BQN1 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM83CQ9BQN1 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM83CQ9BQN1 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM83CQ9BQN1 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM83CQ9BQN1 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM83CQ9BQN1 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM83CQ9BQN1 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM83CQ9BQN1 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM83CQ9BQN1 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM83CQ9BQN1 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM83CQ9BQN1 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM83CQ9BQN1 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM83CQ9BQN1 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM83CQ9BQN1 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM83CQ9BQN1 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM83CQ9BQN1 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM83CQ9BQN1 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM83CQ9BQN1 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM83CQ9BQN1 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM83CQ9BQN1 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM83CQ9BQN1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM83CQ9BQN1 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM83CQ9BQN1 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM83CQ9BQN1 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM83CQ9BQN1 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM83CQ9BQN1 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM83CQ9BQN1 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM83CQ9BQN1 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM83CQ9BQN1 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM83CQ9BQN1 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM83CQ9BQN1 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM83CQ9BQN1 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM83CQ9BQN1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM83CQ9BQN1 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM83CQ9BQN1 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM83CQ9BQN1 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM83CQ9BQN1 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM83CQ9BQN1 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM83CQ9BQN1 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM83CQ9BQN1 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM83CQ9BQN1 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM83CQ9BQN1 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM83CQ9BQN1 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM83CQ9BQN1 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM83CQ9BQN1 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM83CQ9BQN1 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM83CQ9BQN1 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM83CQ9BQN1 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM83CQ9BQN1 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM83CQ9BQN1 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM83CQ9BQN1 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM83CQ9BQN1 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM83CQ9BQN1 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM83CQ9BQN1 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM83CQ9BQN1 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms