Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SPOCK3Q9BQ16 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SPOCK3Q9BQ16 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SPOCK3Q9BQ16 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SPOCK3Q9BQ16 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SPOCK3Q9BQ16 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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SPOCK3Q9BQ16 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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