Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms