Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

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Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP1Q9BPW8 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP1Q9BPW8 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP1Q9BPW8 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP1Q9BPW8 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP1Q9BPW8 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP1Q9BPW8 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP1Q9BPW8 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP1Q9BPW8 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP1Q9BPW8 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP1Q9BPW8 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP1Q9BPW8 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP1Q9BPW8 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP1Q9BPW8 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP1Q9BPW8 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP1Q9BPW8 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP1Q9BPW8 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP1Q9BPW8 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP1Q9BPW8 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP1Q9BPW8 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP1Q9BPW8 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP1Q9BPW8 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP1Q9BPW8 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP1Q9BPW8 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP1Q9BPW8 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP1Q9BPW8 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP1Q9BPW8 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP1Q9BPW8 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP1Q9BPW8 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP1Q9BPW8 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP1Q9BPW8 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP1Q9BPW8 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP1Q9BPW8 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP1Q9BPW8 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP1Q9BPW8 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP1Q9BPW8 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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