Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SEMA3CQ99985 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SEMA3CQ99985 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SEMA3CQ99985 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SEMA3CQ99985 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SEMA3CQ99985 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SEMA3CQ99985 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SEMA3CQ99985 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA3CQ99985 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA3CQ99985 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA3CQ99985 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA3CQ99985 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA3CQ99985 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA3CQ99985 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA3CQ99985 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA3CQ99985 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA3CQ99985 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA3CQ99985 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA3CQ99985 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA3CQ99985 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA3CQ99985 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA3CQ99985 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA3CQ99985 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA3CQ99985 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA3CQ99985 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA3CQ99985 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA3CQ99985 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA3CQ99985 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA3CQ99985 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA3CQ99985 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA3CQ99985 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA3CQ99985 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA3CQ99985 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA3CQ99985 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA3CQ99985 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA3CQ99985 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA3CQ99985 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA3CQ99985 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA3CQ99985 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA3CQ99985 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA3CQ99985 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA3CQ99985 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA3CQ99985 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA3CQ99985 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA3CQ99985 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA3CQ99985 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA3CQ99985 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA3CQ99985 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA3CQ99985 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA3CQ99985 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA3CQ99985 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA3CQ99985 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA3CQ99985 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA3CQ99985 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA3CQ99985 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA3CQ99985 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA3CQ99985 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA3CQ99985 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA3CQ99985 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA3CQ99985 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA3CQ99985 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA3CQ99985 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms